Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SGF29Q96ES7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SGF29Q96ES7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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