Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms