Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 EPHA5-201ENST00000273854 8266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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