Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
APOBEC4Q8WW27 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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