Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KIAA1549LQ6ZVL6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms