Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms