Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms