Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A1Q6PCB7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms