Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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MED27Q6P2C8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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MED27Q6P2C8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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MED27Q6P2C8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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MED27Q6P2C8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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MED27Q6P2C8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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MED27Q6P2C8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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