Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.5 ms