Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
WSCD1Q658N2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms