Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LDLRAP1Q5SW96 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms