Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PERM1Q5SV97 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms