Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms