Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms