Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms