Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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PTPROQ16827 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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