Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLPPQ16740 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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