Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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ECM1Q16610 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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ECM1Q16610 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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ECM1Q16610 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ECM1Q16610 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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