Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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SGCBQ16585 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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