Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms