Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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