Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDCD2Q16342 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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