Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTRK3Q16288 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms