Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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