Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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