Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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