Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA2Q15822 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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