Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms