Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
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NCOA1Q15788 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
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NCOA1Q15788 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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NCOA1Q15788 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
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NCOA1Q15788 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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NCOA1Q15788 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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NCOA1Q15788 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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