Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms