Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRAM2Q15035 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms