Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIXQ14938 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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