Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CNGB1Q14028 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CNGB1Q14028 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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