Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CAPSQ13938 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CAPSQ13938 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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