Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
APOFQ13790 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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APOFQ13790 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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