Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATP1A4Q13733 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATP1A4Q13733 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms