Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTCH1Q13635 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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