Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF5Q13568 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms