Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATRQ13535 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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