Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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