Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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STRN3Q13033 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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