Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRDM2Q13029 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRDM2Q13029 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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