Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXF2Q12947 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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