Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COX10Q12887 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
COX10Q12887 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
COX10Q12887 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
COX10Q12887 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms