Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIN2AQ12879 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms