Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms