Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPAQ06546 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms