Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms