Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms